Obiectele principale ale evidenţei SI sunt:
- Cazurile de boli infecţioase atît de provenienţă umană (individuale şi colective) cît şi de provenienţă animalieră, care se înregistrează în SI prin intermediul documentelor: documentele de bază pe hîrtie, documentele electronice transmisibile în SI (din exterior) de pe purtători externi;
- Îndreptări la analize de laborator şi rezultate ale acestora.
- Evidenţa centralizată a datelor singulare despre toate cazurile de boli infecţioase din ţară;
- Evidenţa centralizată a mesajelor despre focarele infecţiei la oameni;
- Evidenţa centralizată a mesajelor despre cazurile de boli infecţioase la animale şi păsări;
- Formarea unei baze de date unice singulare a cazurilor de boli infecţioase;
- Fluxul operativ de date către serviciile interesate;
- Realizarea analizei operative şi retrospective a situaţiei epidemiologice.
- Pregătirea periodică a materialelor informativ-analitice pentru desfăşurarea analizei operative a situaţiei epidemiologice;
- Pregătirea periodică a materialelor informativ-analitice pentru organele puterii executive;
- Întocmirea evidenţei statistice de stat.